Neisseria gonorrhoeae¶
Os dados Neisseria gonorrhoeae são provenientes de Pathogenwatch, que chama AMR e a linhagem genotypes (MLST, NG-MAST) de genomes montados a partir de dados públicos. As estimativas de prevalência mostradas são calculadas utilizando coleções de genomas derivadas de quadros de amostragem não direcionados (i. . Estudos sobre vigilância e sobrecarga, em vez de estudos centrados na RAM ou investigações de surto). Estes incluem o EuroGASP 2013 & 2018, e vários estudos nacionais de vigilância. Última atualização: 5 de agosto de 2025.
Definições de variáveis¶
Genotipos: tipos sequenciais do 7-locus MLST scheme para Neisseria, ou 2-locus N. gonorrhoeae seqüência de multi antigen (NG-MAST), ambos hospedados por PubMLST.
AMR determinants are identified by Pathogenwatch using an inhouse dictionary developed and maintained in consultation with an expert advisory group, described here.
AMR determinantes dentro dos genótipos - Este gráfico mostra combinações de determinantes que resultam em resistência clínica a Azithromycin ou Ceftriaxone, conforme definido na Figura 3 de Sa➲ nchez-Buso├et al (2021).
Drogas I/II suspeitas - Nenhum determinante encontrado para Azithromycin, Ceftriaxone, Cefixime (categoria I) ou Benzylpenicillin, Ciprofloxacin, Spectinomycin (categoria II).
Abreviações¶
DR: multidroga resistente (resistente a uma das Azithromycin / Ceftriaxone / Cefixime [categoria I representativas], mais dois ou mais de Benzylpenicillin / Ciprofloxacin / Spectinomycin [representantes da categoria II])
XDR: Drogas extensivamente resistentes (resistente a duas de Azithromycin / Ceftriaxone / Cefixime [categoria I representatives], mais três de Benzylpenicillin / Ciprofloxacin / Spectinomycin [representantes da categoria II])
Nota
Estas definições são baseadas nas definidas no Plano de Resposta do CDC Europeu, modificado para usar os representantes específicos das classes de antibióticos de categoria I e II que estão disponíveis no painel.
Fonte de dados¶
Os dados são recolhidos de estudos com as seguintes IDs de publicação:
Adesão de estudo |
TPM |
|---|---|
PRJEB58139 |
38614111 |
PRJEB4024 |
32013864 |
PRJEB4024 |
31358980 |
PRINA266539 |
25378573 |
PRINA298332 |
26935729 |
PRJEB7904 |
27638945 |
PRINA348107 |
28510723 |
PRJEB23008 |
29523496 |
PRJEB14168 |
28348871 |
PRJNA209340, PRJNA209376, PRJNA209345, PRJNA209319 PRJNA209352, PRJNA209333, PRJNA209347, PRJNA209316 PRJNA209466, PRJNA209373, PRJNA209465, PRJNA209351 PRJNA209342, PRJNA209343, PRJNA209320, PRJNA209470 |
25780762 |
PRJEB17738 |
29247013 |
PRJEB10104 |
29701830 |
PRJDB6504,PRJDB6496 |
30063202 |
PRJEB34425 |
32068837 |
PRJEB10016 |
32829411 |
PRJNA392203 |
29367612 |
PRJNA473385 |
29882175 |
PRJEB19989 |
31978353 |
PRJEB9227 |
29776807 |
PRJNA394216 |
29182725 |
PRINCIPAL |
30788502 |
PRJEB14933 |
26601852 |
PRJEB32435 |
33200978 |
PRINCIPAL |
27427203 |
PRJEB34425 |
32068837 |
PRJNA317462, PRJNA329501 |
32071056 |
PRJEB32435 |
32213251 |
PRINA520805 |
31488838 |
PRJEB34068 |
35659907 |
PRJEB2999 |
24462211 |
PRJEB32435 |
32213251 |
PRJEB49317 |
35467402 |
PRJEB47922 |
35095823 |
PRJEB50649 |
37216766 |
PRJEB36607 |
32785692 |
PRJEB36608 |
30820563 |
PRJEB40983 |
33739419 |
PRJEB41007 |
34424175 |
PRINCIPAL |
27427203 |
PRINCIPAL |
30788502, 33005903, 33993166, 37171855 |
PRINA329501 |
33005903 |
PRINA278367 |
26358608 |
PRJNA481622 |
32977759 |
PRJNA575338 |
32868325 |
PRJNA594714 |
32571818 |
PRINA664319 |
33760080 |
PRINA681740 |
34280016 |
PRJNA684048 |
34683991 |
PRINA738299 |
34755593 |
PRINA522696 |
10.1136/sextrans-2019-054025 |
PRINA776899 |
36735316 |
PRJNA785548 |
34978884 |