Diarreia de équica diarreia

Enterobase classifica os gêneros E. coli aos pathotypes usando esta lógica. Pathotypes incluídos no painel E. coli (diarreia) são:

  • E. coli (STEC) da toxina Shiga

  • Enterohemorrágico E. coli (EHEC)

  • Enterotoxínica E. coli (ETEC)

  • Enteropathogenic E. coli (EPEC)

  • Enteroinvasive E. coli (EIEC)

Última atualização: 5 de Agosto de 2025.

Aviso

O E. coli dados usados na AMRnet ainda não são curados para efeitos de amostragem, e, portanto, refletem as preconceitos dos esforços globais de sequenciamento que podem ser orientados para a sequenciação de tensões e/ou surtos de RAM. No entanto, os esforços de curadoria de dados estão em curso até lá, por favor, tenha cuidado ao interpretar os dados no painel.

Definições de variáveis

  • Linhas: as Linhas são rotuladas pelo pathovar seguido pelo ST(7-locus).

  • AMR determinants: Enterobase identifies AMR determinants using NCBI’s AMRFinderPlus run with default settings. AMRnet imports these AMR genotype calls, and assigns them to drugs/classes in the dashboard using the Subclass curated in refgenes, see the table.