Esclerichia coli

Dados Escherichia coli no AMRnet são desenhados a partir de Enterobase, que chama genotipos AMR usando o AMRFinderPlus <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens/antimicrobial-resistance/AMRFinder/>do NCBI e atribui linhagens utilizando MLST, `cgMLST e o cluster hierárquico. Última atualização: 5 de Agosto de 2025.

Aviso

O E. coli dados usados na AMRnet ainda não são curados para efeitos de amostragem, e, portanto, refletem as preconceitos dos esforços globais de sequenciamento que podem ser orientados para a sequenciação de tensões e/ou surtos de RAM. No entanto, os esforços de curadoria de dados estão em curso até lá, por favor, tenha cuidado ao interpretar os dados no painel.

Definições de variáveis

• Linhas: as Linhas são rotuladas pelo tipo sequencial de 7-locus (T).

• AMR determinants: Enterobase identifies AMR determinants using NCBI’s AMRFinderPlus run with default settings. AMRnet imports these AMR genotype calls, and assigns them to drugs/classes in the dashboard using the Subclass curated in refgenes. see the table